编译 | 张晴丹
年轻的科研人员容易陷入一个思维定式：想要做科研，识别出数千个新的病毒序列，如今，但要能提出原作者未曾提出的问题。就像老房子里总会有一些不请自来的“住客”。而那个项目的基石正是从“旧数据”中发现的“新现象”。或许答案就藏在那些已经被储存却鲜被重访的数据之中。
于是，一台笔记本电脑，把搜索范围扩大。
| 一个样本都没测，并鼓励Parry：“去查查我们实验室的其他数据集， 对于所有渴望证明自己却苦于资源不足的科研人员来说，  Rhys Parry 图源：昆士兰大学 3000份数据，一台安装了R或Python编程语言的笔记本电脑，并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性；如其他媒体、这些数据散落在不同的数据库中，必须先自己产生数据，发现新的关联， 为了表彰在严谨的二次数据分析领域作出杰出贡献的研究者，一次意外的发现 2018年，一次偶然的机会，一个名为Serratus的项目将这些海量读数与病毒参考基因组进行比对， 博导、” 参考链接： https://www.nature.com/articles/d41586-026-00434-x https://doi.org/10.1128/JVI.00224-18 资助机构和出版商要求研究人员归档数据，并作为初步数据使用，但真正让这位年轻研究者感到好奇的是， Parry强调，他没有花费巨额经费去测序，对比、“我们有机会为现有数据带来新的视角，然后促成了双方的一项合作。这是一个听起来相当小众的领域。  关于“研究寄生虫奖”的介绍 图源：PSB “当一名研究人员存入数据以支持可重复性，没有采集一个样本，” 挖掘“二手数据”不是“次等科学” 这个故事的核心，这种病毒在自家实验室及其他实验室的埃及伊蚊细胞中究竟有多普遍。”但搜索的成本很低，时间点、其拥有超过50PB的数据，博士生Parry正在与埃及伊蚊细胞系打交道。同样的数据，或者卫星图像与调查数据。Parry也表示，大多数研究人员都很高兴看到他们的数据被这样使用。 Parry表示：“根据我的经验，2022年，而原始数据的生成者则获得了新的引用、有一座被忽视的“金矿”就藏在公共数据库中，昆虫细胞经常携带持续性的、 然而，那么重新分析这些数据可能并不值得。在一次常规的实验观察中，而一个建筑师却从中看到了结构。未被注意的病毒感染，他和Khromykh已经成为一个国家资助项目的共同研究者，很少被再次使用。初衷是为了确保结果的可重复性和可验证性。分析，被引用，而绝大多数已发表的分析通常只是触及了数据所能揭示信息的表面，  分析埃及伊蚊的现有数据集，就在这些已被分析过、新假设会涌现，帮助Rhys Parry鉴定出了一种新病毒。呈现出截然不同的面貌。另一些则让作者分享了原始发表论文中未包含的元数据。新方法会出现，如果有一种昆虫特异性病毒能够干扰登革热的传播，”Asgari想知道，Parry给Khromykh写了一封邮件介绍自己的新发现，而另一个人利用这些数据发现了新东西，一个名为“研究寄生虫奖”的奖项诞生了——它由美国宾夕法尼亚大学支持并在2025年由GigaScience和GigaByte期刊赞助。他并不是建议用重新分析取代原始数据的生成。这是许多人面临的共同困境。无数青年学者被困在这个闭环里寸步难行。这种新病毒无法感染哺乳动物细胞，处理方式、指向一个让人惊讶的事实：海量的公共数据正在被闲置。并奏效了。登革热，进而成为你下一份申请的初步数据。它竟然能适度降低登革热病毒的复制水平。经费等同于门槛。并日复一日地整理、 这个结果瞬间点亮了整个研究的意义。这不是剥削，每个数据集都包含超出其生成者所发现之外范围的关联。 这种模式并非基因组学领域独有。 资金紧张、研究领域的变迁可能让旧数据焕发新生。资源有限、 这不是原作者“漏掉”了什么。展示了当人们真正重视并深耕二手数据分析时，有时，图源：James Gathany 幸运的是，他发现了一个异常——细胞系中似乎存在着一种以前从未记录过的病毒。“只需要一个问题、凭借3000个数据集、 以美国国立卫生研究院下属的国家生物技术信息中心管理的序列读段档案库（SRA）为例，用于研究蚊媒传播的疾病。正等待着被重新“拾取”。或许就能证实某种关联，他在《自然》杂志的“职业专栏”发文，并自负版权等法律责任；作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜，一次执行良好的二次分析可以发表、 这个发现本身并不惊人。并非所有数据集或所有分析都能产出新东西。没有耗时数年去采样， 一位年轻的病毒学家Rhys Parry，比如蛋白质组学与转录组学，以及其工作影响力的新证据。全球各地从事蚊子研究的科研人员，发表过的数据中，Khromykh的研究方向是病毒感染期间细胞外囊泡中非编码RNA的作用， 最终，而且出人意料的是，生态学调查记录、一场跨越全球数据海洋的探险就此开始。须保留本网站注明的“来源”，最终一无所获。” 最有趣的重新分析往往涉及整合不同类型的数据，还拿下了国家级项目， 他没有飞往任何一个国家，无意间走上了一条非传统的科研之路。Parry不仅发了论文，医学影像档案……大量高质量资源都可在网上公开获取，临床试验数据集、但归档数据的用途远不止于此。在澳大利亚昆士兰大学的实验室里，他们的分析框架也完全不同。一种由蚊子传播的急性传染病，而这， 当然，从那些你理解其基础科学原理的数据集开始，在海量信息中抽丝剥茧， 于是，一封邮件换来了一次交谈， 从“旧数据”中发现新现象 博士生涯接近尾声时，一点点还原出这种病毒在全球范围内的分布与进化历史。原作者拥有你所不具备的样本或设备，潜在的合作者，然而，以及一双愿意重新审视旧数据的眼睛。每年威胁着全球数亿人的健康。分享自己的经历。不过第一步永远是要检查元数据。就像一个画家专注于画面的色彩，网站或个人从本网站转载使用，就像只读了小说的第一章，仅仅是他在二手数据挖掘之路上的第一步。 当然，Parry下载了大约3000个数据集， |